Doctora en Bellas Artes con una tesis sobre el cine de animación experimental en el País Vasco. Completó sus estudios de Licenciatura en Pilot Studio de Moscú con Tatarski y Sramkowski y posteriosmente en Vitoria Design Center.
Como realizadora de cine cuenta en su haber con trabajos como Pregunta por mí (1997), Haragia/Carne Humana (2000), Beti Bezperako Koplak (2015 colectivo Agedakoplak), Areka (2016 colectivo Atxur ), Miraila (2017 colectivo Armintxe) y En la luna (2018, colectivo Hauazkena), todas ellas ampliamente difundidas y premiadas en festivales internacionales, entre los que destacan el premio Goya, el premio del festival de cine experimental de Madrid o el Gran Premio del Cine Vasco Zinebi.
Ha escrito, además de numerosos artículos y ponencias, varios libros sobre cine de animación entre los que destacan Breve historia del cine de animación experimental vasco. (1998-Semana de Cine Experimental de Madrid), Mamá, quiero ser artista: entrevistas a mujeres del cine de animación (Herguera, Vicario ,2004,Ocho y Medio) y Sistiaga, el trazo vibrante, 2008-Animadrid, Festival internacional de cine de animación).
Begoña Vicario imparte docencia el Grado de Arte y en el Máster de Arte Contemporáneo (MACTP) de la Facultad de Bellas Artes de la UPV/EHU, participa en diversos proyectos de investigación y cuenta con tres sexenios de investigación reconocidos. Actualmente coordina el grupo de animación Hauazkena con el que trabaja en dos nuevos proyectos cinematográficos y colabora con otros artistas, como Josu Rekalde, para el proyecto de videoarte Denboraren Hariak, dotado con la prestigiosa beca Multiverso o en el grupo de investigación Akmeka IT1278-19.
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